鉬酸鈉有毒，但屬低毒化學物質。鉬中毒了會造成關節痛，導致血壓偏高稍低和血壓偏高起伏，神經功能失調，代謝全過程出現阻礙。可溶鉬化物大氣氣溶膠多允許濃度值為2mg/m，煙塵為4mg/m。觸碰和應用鉬酸鈉時，要配戴要求的安全防護用品。留意防滲。運送時需防淋雨、風吹日曬。鉬是黃嘌呤氧化酶、醛氧化酶和亞硫酸氧化酶充分發揮生物體魅力的必不可少系數，對人體氧化還原反應全過程中的電子傳遞、嘌呤化學物質與硫含量碳水化合物的代謝具備一定的危害。

另外鉬還能抑止結腸對鐵、銅的吸收，其體制將會是鉬可競爭性抑制結腸黏膜刷狀緣上的蛋白激酶，或產生不容易被吸收的銅-鉬復合物、硫-鉬復合物或硫鉬酸銅（cu-mos）并使之不可以與血液血清鐵等含銅蛋白融合。